Fen eğitimi alanında derinlemesine bilgiye, güçlü araştırma yeterliklerine ve etik değerlere sahip nitelikli araştırmacılar ve eğitimciler yetiştirmektir. Programlar, öğrencilerin fen bilimleri alanındaki kuramsal bilgi birikimlerini çağın gerektirdiği teknolojik, pedagojik ve bilimsel yeterliklerle bütünleştirerek disiplinler arası bakış açısı kazanmalarını amaçlar. Bu doğrultuda programlar ile bilimsel araştırma yöntemlerini etkin şekilde kullanabilen, alandaki güncel gelişmeleri takip edebilen, fen eğitimi alanında projeler ve özgün araştırmalar tasarlayıp yürütebilen ve sonuçları ulusal ve uluslararası akademik platformlarda paylaşabilen öğrenciler yetiştirilmesi hedeflenmektedir. Programlar ayrıca, araştırmaların toplumsal yararı gözeterek bilimsel bilginin topluma aktarımını ve sürdürülebilir kalkınmaya katkı sağlamayı esas alır.

Fen eğitimi alanında ulusal ve uluslararası düzeyde tanınan, öğretmen eğitiminde yüksek kalite standartlarına sahip, yenilikçi ve öncü bir lisansüstü program olmaktır. Bu vizyon doğrultusunda program; alanında güncel gelişmeleri takip eden, bilimsel bilgi üretiminde aktif rol üstlenen, yürüttüğü veya katıldığı projelerle fen eğitimi araştırmalarına katkı sağlayan, paydaşlarıyla etkili iletişim ve iş birliği kurabilen, araştırma temelli düşünme ve uygulama becerileri gelişmiş öğretmenler ve akademisyenler yetiştirmeyi hedeflemektedir.

Matematik eğitiminde ulusal ve uluslararası düzeyde tanınan, yeniliklere ve gelişmelere açık, araştırma ve öğretimde öncü bir program olmak; çağdaş anlayışa sahip, etik değerlere bağlı ve toplumsal gelişime katkı sunan uzman matematik öğretmenleri yetiştirerek, matematik okuryazarlığının artmasına öncülük etmek.

Matematik eğitimi alanında özgün araştırmalar yapabilen, alan bilgisi güçlü, 21. yüzyıl becerilerine sahip, kendini sürekli geliştiren ve yenilikleri takip ederek öğretim süreçlerine yansıtan uzman matematik öğretmenleri yetiştirmektir. Program, öğrencilerin matematiksel düşünme becerilerini kullanarak günlük yaşam problemlerine çözüm üretebilmelerini, bu çözümlerden genellemelere ulaşabilmelerini ve elde ettikleri bilgileri farklı durumlara aktarabilmelerini hedefler.